Анатолий Алимович Ахунжанов родился в 1986 году в г.Семей области Абай.
В 2010 году окончил Государственный медицинский университет г.Семей по специальности «Педиатрия», в 2011 году — интернатуру по специальности «Врач общей практики».
С 2011 по 2014 год работал в КГП НА ПХВ «Поликлиника № 4 г. Павлодара» заведующим отделением профилактики и социально-психологической помощи. В этот период прошел специализацию как врач онколог-маммолог.
В 2014 году работал главным специалистом ГУ «Управление здравоохранения Павлодарской области». 2018 — 2020 годы был на должности директора медицинского центра «Омир-ПВ», с 2021 по 2022 год руководил клиникой «А3 Мед». 2022 — 2023 годы был на должности медицинского директора клиники ТОО «Каз Мед А».
С 17 мая 2023 года назначен главным врачом КГП на ПХВ «Поликлиника №1 г.Семей» УЗ области Абай.